潔凈室作為粒子數量嚴格受控的區域，其不僅需要對塵埃粒子等非活性粒子進行管控，對微生物這類活性粒子同樣需要進行控制。
采用撞擊或沖擊原理的采樣器，在采樣時會將空氣吸入采樣裝置，使其所含有的活性粒子撞擊到培養基上。撞擊的速度應兼顧物理效率和生物效率，即速度高到足以捕獲小至1μm的活性粒子（物理效率），低到不會對細菌或霉菌團造成機械破碎或損傷，以保證活性粒子的存活力（生物效率）。因此，物理效率和生物效率可以看做是一對矛盾的共同體，如何在兩者中做出平衡是衡量一臺主動式采樣設備采集效率的核心要素。
